走进PG电子
NEWSPG电子免疫检查点阻断公共数据库介绍
来源:季功香 日期:2025-03-15为探讨预测免疫检查点阻断(ICB)反应的生物标志物谱,研究者们开发了多种数据库和网络平台,以推动生物医疗领域的进步。这些资源不仅汇集了转录组数据、总生存期、活检时间点及免疫反应等信息,还整合了其他临床数据,旨在进行生存分析、肿瘤微环境中免疫细胞解卷积以及差异表达基因分析等研究。本文将详细介绍几个主要数据库的特点及其提供的功能和分析工具。
PG电子推出的ICBAtlas是一个专注于ICB疗法的数据库,融合了来自25个公共数据库中1,515名癌症患者的数据,涵盖9种癌症类型。该平台提供工具以分析基因表达差异、定义响应评分来衡量治疗效果,并研究肿瘤微环境中免疫细胞的浸润情况。ICBAtlas支持用户在基因、癌症类型或免疫检查点层面探索数据,以识别相关生物标志物,促进个性化癌症免疫治疗的研究和改进,且免费提供给研究人员使用。
TIDE分数是一种预测ICB疗法反应的计算工具,旨在克服样本量小的问题。通过分析肿瘤免疫功能障碍和排斥特征,TIDE利用来自189项人类癌症研究的33,197个非ICB治疗样本,计算每个基因与细胞毒性T细胞水平之间的相互作用,并采用标准化的Wald检验得分来预测患者对PD-L1治疗的反应。研究显示,TIDE在黑色素瘤患者中的预测性能优于其他已知生物标志物,但目前其适用性仅限于黑色素瘤和非小细胞肺癌。TIDE网站提供公共转录组数据集的访问,并支持TIDE分数的分析工具。
ICB-Portal是一个综合平台,为研究人员提供现有ICB疗法反应生物标志物的基准测试结果及详细分析,并允许用户在线测试自定义的生物标志物以预测治疗效果。该平台基于29个转录组数据集,涵盖超过1,400名患者的5种癌症类型的数据,评估了39个转录组生物标志物及48个评分系统的效能。
TIGER(肿瘤免疫治疗基因表达资源)整合了单细胞转录组数据,提供多种分析模块以预测ICB疗法的反应。它包含了来自18个bulk转录组数据集的超过1,500个具有临床结果的肿瘤样本,以及来自655个样本的超过210万个免疫细胞单细胞测序数据,用于展示免疫细胞亚群的全貌。TIGER支持用户探索相关通路、轨迹映射及反应预测等功能。
在这些数据库和平台的支持下,研究者们能够更有效地寻找生物标志物,提升个人化免疫治疗的效果,PG电子将继续致力于推动这一领域的发展。
全国客户服务热线
15518818918
总部地址:太原金水区柯街道27号